首先需要清洗的苹果全部放入水槽,在高压水流和强力气泡的作用下,被充分打散、翻滚、清洗、传送。苹果表面的泥沙会脱落。沉淀到底部的隔离舱，防止了翻扬回流造成再度污染。而从果苹果上洗落下来的杂物和小虫会漂浮在水面。然后被网孔收集，溢出水槽的水流被排除水箱，进入尼龙袋中。苹果被苹果清洗机洗干净后，在经过喷淋的清洗，然后通过传送带送出，传送带末端有一个吹起装置，会把没有被彻底清理掉的杂物吹蒸。
苹果清洗机工作是臭氧发生器产生臭氧，由臭氧泵通过臭氧管输送到洗菜机的洗涤桶中，在洗涤桶中与水机接融，溶解在水中形成臭氧水，臭氧水具有很强的杀菌、消毒、降解农药作用。它采用不同的清洗工作和清洗模式可能会使耗水量有所改变，选择合适的苹果清洗机设备也是很重要的因素之一，通过对果蔬及食物净化、消毒灭菌： 由表及里的降解苹果中残留农药等有毒物质，清楚肉类、海鲜中的抗生素、化学添加剂、激素、重金属离子等有害物质。